常见的真核细胞翻译的起动因子的功能
(了解一下就行,考博也从来没有考过)
各种版本的教材和专著上写的常见的真核细胞翻译的起动因子的功能太乱了,我根据Michael B.Mathews, Nahum Soneberg,John W.B.Hershey,Translational Control on Biology and Medicine,Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2007, 整理了出来。
1.eIF1:起始密码子的识别:(1)使不正确的密码子与反密码子配对解离并且correct parings in poor sequence contexts in P site,(2)介导40S亚基对于正确的AUG密码的辨识的相关反应。参与确保起始密码子选择的忠实性(与原核的IF3相似)。
2.eIF1A:与原核生物的IF1功能相似,eIF1A可以占领真核细胞的核糖体A位(40S亚基),并使得40S亚基的一些结构域的相对位置发生变化。此外,eIF1A与eIF1还能够增强eIF3将80S核糖体解离为40S和60S亚基的活性。
3.eIF2:携带(Met-tRNAi Met)与40S亚基结合,形成三元复合体(40S complex),eIF2有GTPase活性。eIF2结合上的GTP水解为GDP+Pi的反应由eIF5介导,结合上eIF2的GDP与GTP交换反应由eIF2B介导。
4.eIF2B:结合在eIF2的GDP更换为GTP的反应由eIF2B催化,否则eIF2B上的GDP掉下来换上GTP的过程非常缓慢。
5.eIF3:有依赖性RNA的(RNA independent)解离80S核糖体为40S和60S亚基的活性,此活性可被eIF1A加强,部分地被eIF1增强。
eIF3能够结合到60S亚基的内表面的平台部位(platform),并且锁住40S亚基到达18Sr RNA元件(18r RNA属于40S亚基的通道),18Sr RNA元件位于40S亚基与60S亚基的内部接触面(inter subunit),并且象一座桥一样连接40S亚基中的B2b和B2d。
eIF3的另外功能:促进mRNA的结合与核糖体40S亚基的结合。
6.eIF4F:eIF4A,Eif4E和eIF4G各一个分子组成一个完整的eIF4F分子。
7.eIF4A:RNA helicase,使mRNA去除二级结构,其本身是较低的非持续性的螺旋酶(nonprocessive helicase),其酶活性能够被eIF4B所活化。也可以认为eIF4B是eIF4A的cofactor,eIF4B可能是增加了eIF4A与mRNA的亲合性而增加了eIF4A的RNA螺旋酶活性。
8.eIF4B:与eIF4A共同行使RNA螺旋酶活性,去除mRNA的二级结构。
9.eIF4E:真核mRNA的5'-帽子的结合蛋白。
10.eIF4G:连结eIF4E与PAB[Poly (A) binding protein]。
11.eIF5:与eIF2结合时会增强eIF2的GTPase活性,eIF5也是核糖体依赖性的GTPase。eIF5的GAP功能对40S亚基与60S亚基的结合是一个必需的先决条件(prerequisite),至少在细胞内是如此,因为敲除了酵母细胞eIF5基因会削弱翻译起并且引起48S前起始复合物(PTCs)的堆积。
12.eIF5B:有GTPase活性,eIF5B结合上GTP但未水解时,会占领核糖体40S亚基的A位。eIF5B的功能与原核的eIF2近似,eIF5B有很弱的结合Met-tRNAi Met活性。
13.eIF6:亚单位解聚,结合于60S亚单位。
参考:Michael B.Mathews, Nahum Soneberg,John W.B.Hershey,Translational Control on Biology and Medicine,Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2007, P113, P91-P94, P100-P101, P103, P110-P111, P116, P104-105, P114, P250-P251, P253-254,P319。
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